Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Vrk3Q8K3G5 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Vrk3Q8K3G5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Vrk3Q8K3G5 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Vrk3Q8K3G5 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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