Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms