Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rbbp5Q8BX09 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp5Q8BX09 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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