Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Nop53Q8BK35 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Nop53Q8BK35 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Nop53Q8BK35 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Nop53Q8BK35 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Nop53Q8BK35 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms