Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z24

Negr1, Neuronal growth regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Negr1Q80Z24 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Negr1Q80Z24 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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