Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih3Q6ZWS4 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms