Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.65□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.65□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.65□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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