Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Pdzrn3Q69ZS0 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Pdzrn3Q69ZS0 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Pdzrn3Q69ZS0 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Pdzrn3Q69ZS0 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Pdzrn3Q69ZS0 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Pdzrn3Q69ZS0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Pdzrn3Q69ZS0 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Pdzrn3Q69ZS0 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Pdzrn3Q69ZS0 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Pdzrn3Q69ZS0 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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