Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Pkp4Q68FH0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Pkp4Q68FH0 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Pkp4Q68FH0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Pkp4Q68FH0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Pkp4Q68FH0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkp4Q68FH0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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