Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Sbno1Q689Z5 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sbno1Q689Z5 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sbno1Q689Z5 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sbno1Q689Z5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Sbno1Q689Z5 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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