Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TefmQ5SSK3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms