Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms