Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ccdc185Q3V118 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ccdc185Q3V118 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ccdc185Q3V118 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ccdc185Q3V118 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ccdc185Q3V118 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ccdc185Q3V118 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ccdc185Q3V118 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ccdc185Q3V118 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ccdc185Q3V118 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ccdc185Q3V118 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ccdc185Q3V118 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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