Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ccdc27Q3V036 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ccdc27Q3V036 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ccdc27Q3V036 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ccdc27Q3V036 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ccdc27Q3V036 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ccdc27Q3V036 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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