Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6899Q3USS0 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms