Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms