Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
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Nkx6-3Q3UHX8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Nkx6-3Q3UHX8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Nkx6-3Q3UHX8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Nkx6-3Q3UHX8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Nkx6-3Q3UHX8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Nkx6-3Q3UHX8 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Nkx6-3Q3UHX8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Nkx6-3Q3UHX8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Nkx6-3Q3UHX8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Nkx6-3Q3UHX8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Nkx6-3Q3UHX8 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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