Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vars2Q3U2A8 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms