Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms