Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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