Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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ptchd1Q14B62 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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ptchd1Q14B62 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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ptchd1Q14B62 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
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