Protein–RNA interactions for Protein: Q148W0

Atp8b1, Phospholipid-transporting ATPase IC, mousemouse

Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b1Q148W0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp8b1Q148W0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp8b1Q148W0 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp8b1Q148W0 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp8b1Q148W0 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp8b1Q148W0 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp8b1Q148W0 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp8b1Q148W0 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp8b1Q148W0 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp8b1Q148W0 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp8b1Q148W0 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp8b1Q148W0 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp8b1Q148W0 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp8b1Q148W0 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp8b1Q148W0 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Atp8b1Q148W0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Atp8b1Q148W0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Atp8b1Q148W0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp8b1Q148W0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp8b1Q148W0 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Atp8b1Q148W0 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Atp8b1Q148W0 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp8b1Q148W0 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Atp8b1Q148W0 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp8b1Q148W0 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Atp8b1Q148W0 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp8b1Q148W0 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp8b1Q148W0 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp8b1Q148W0 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp8b1Q148W0 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atp8b1Q148W0 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Atp8b1Q148W0 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Atp8b1Q148W0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b1Q148W0 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Atp8b1Q148W0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Atp8b1Q148W0 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b1Q148W0 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b1Q148W0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b1Q148W0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b1Q148W0 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b1Q148W0 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b1Q148W0 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b1Q148W0 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b1Q148W0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b1Q148W0 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Atp8b1Q148W0 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b1Q148W0 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b1Q148W0 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atp8b1Q148W0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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