Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Itgb8Q0VBD0 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms