Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ubxn2bQ0KL01 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ubxn2bQ0KL01 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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