Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnnm1Q0GA42 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms