Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms