Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RhodP97348 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RhodP97348 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RhodP97348 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
RhodP97348 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
RhodP97348 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RhodP97348 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
RhodP97348 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RhodP97348 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RhodP97348 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms