Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms