Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms