Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CgnP59242 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CgnP59242 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CgnP59242 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CgnP59242 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CgnP59242 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CgnP59242 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CgnP59242 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CgnP59242 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CgnP59242 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CgnP59242 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CgnP59242 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CgnP59242 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CgnP59242 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CgnP59242 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CgnP59242 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CgnP59242 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CgnP59242 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CgnP59242 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CgnP59242 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CgnP59242 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CgnP59242 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CgnP59242 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CgnP59242 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CgnP59242 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CgnP59242 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CgnP59242 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CgnP59242 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CgnP59242 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CgnP59242 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CgnP59242 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CgnP59242 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CgnP59242 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CgnP59242 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CgnP59242 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CgnP59242 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CgnP59242 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CgnP59242 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CgnP59242 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CgnP59242 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CgnP59242 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CgnP59242 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CgnP59242 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CgnP59242 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CgnP59242 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CgnP59242 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CgnP59242 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CgnP59242 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CgnP59242 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CgnP59242 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CgnP59242 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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