Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GferP56213 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GferP56213 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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