Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LmnaP48678 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LmnaP48678 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LmnaP48678 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms