Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lig1P37913 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Lig1P37913 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms