Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms