Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgfb2P27090 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms