Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RarbP22605 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RarbP22605 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RarbP22605 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RarbP22605 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RarbP22605 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RarbP22605 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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RarbP22605 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RarbP22605 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RarbP22605 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RarbP22605 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RarbP22605 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RarbP22605 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RarbP22605 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RarbP22605 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RarbP22605 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RarbP22605 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RarbP22605 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RarbP22605 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RarbP22605 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RarbP22605 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RarbP22605 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RarbP22605 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RarbP22605 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RarbP22605 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RarbP22605 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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