Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.8 ms