Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P20040 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
P20040 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P20040 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P20040 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P20040 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P20040 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
P20040 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P20040 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P20040 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P20040 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P20040 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P20040 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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