Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P10404 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P10404 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P10404 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
P10404 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P10404 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
P10404 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
P10404 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P10404 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P10404 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P10404 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P10404 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P10404 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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