Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P01649 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01649 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01649 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01649 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01649 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01649 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01649 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01649 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01649 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01649 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01649 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01649 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01649 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01649 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01649 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01649 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01649 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01649 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01649 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01649 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01649 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01649 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01649 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01649 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01649 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01649 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01649 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01649 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01649 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01649 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms