Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp4O70480 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms