Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BckdkO55028 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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BckdkO55028 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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BckdkO55028 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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BckdkO55028 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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BckdkO55028 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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BckdkO55028 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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BckdkO55028 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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BckdkO55028 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BckdkO55028 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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BckdkO55028 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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BckdkO55028 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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BckdkO55028 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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BckdkO55028 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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