Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FxnO35943 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms