Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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