Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Eftud2O08810 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms