Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm3727J3QM54 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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