Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms