Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms