Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Nccrp1G3X9C2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Nccrp1G3X9C2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Nccrp1G3X9C2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Nccrp1G3X9C2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Nccrp1G3X9C2 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Nccrp1G3X9C2 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Nccrp1G3X9C2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nccrp1G3X9C2 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms