Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms